Чтобы разместить заказ, скопируйте в поле «импорт праймеров» таблицу из MS Word или Excel. Один праймер должен занимать одну строку, а столбцы содержать следующую информацию:
- Название праймера
- Последовательность 5' - 3'
Буквы в последовательности могут быть разделены дефисами (-) или пробелами, либо записаны подряд, без разделения. Лишние символы будут удалены. Для обозначения вырожденных нуклеотидов используйте однобуквенный код IUPAC. При заказе TaqMan зондов или праймеров с модификациями, необходимые модификации должны стоять в соответствующем месте последовательности. Они могут быть выделены скобками - (ROX), слешами - /ROX/, или остаться без выделения - ROX, форма распознает их в любом случае. - Масштаб синтеза
Доступны 3 шкалы синтеза: 0,04 мкмоль (5 ОЕ), 0,2 мкмоль (15 ОЕ) и 1 мкмоль (80 ОЕ). Количество в ОЕ указано из расчета праймера длиной 20 нуклеотид. Если оставить поле пустым, будет принято стандартное значение 0,04. - Сведения об очистке
Если вам необходима дополнительная очистка HPLC, поставьте «1» в соответствующем поле. Если очистка не нужна, поставьте «0» или оставьте поле пустым. В тех случаях, когда очистка необходима, например, при синтезе зондов, она включается автоматически. В таких случаях поле “Очистка HPLC” можно оставить пустым.
ПримерНазвание | Последовательность 5’–3’ | Масштаб синтеза | Очистка HPLC |
Zond1 | 6-FAM GAC-ACG-ATT-TAC-CAC-TGA-AT BHQ-1 | 0.04 | |
Zond2 | (6-FAM) GACACGAT (dT-BHQ1) TTACCACTGAAT (Pi) | 0.04 | |
M13 | GTT GTA AAA CGA CGG CCA GTG | 0.2 | |
M13rev | AGC-GGA-TAA-CAA-TTT-CAC-ACA-GGA | 1 | 0 |
T7dir | TAA TAC GAC TCA CTA TAG GG | 0.04 | 1 |
Также можно импортировать праймеры, записанные не в таблице, а списком. В качестве разделителя между Названием, Последовательностью, Шкалой и Очисткой в таком случае должен быть либо знак “;”, либо табуляция.
Пример
Zond1; 6-FAM GAC-ACG-ATT-TAC-CAC-TGA-AT BHQ-1; 0.04
Zond2; (6-FAM) GACACGAT (dT-BHQ1) TTACCACTGAAT (Pi); 0.04
M13; GTT GTA AAA CGA CGG CCA GTG; 0,2; 1
M13rev; AGC-GGA-TAA-CAA-TTT-CAC-ACA-GGA; 0,04; 0
T7dir; TAA TAC GAC TCA CTA TAG GG; 0,04
После импорта праймеры можно редактировать, удалять, добавлять модификации. Для этого нужно выделить один или несколько праймеров и внести необходимые изменения в форме «Редактирование праймеров». Там же можно добавлять праймеры по одному. Для этого нажмите «Добавить», заполните все обязательные поля (Название, Последовательность, Шкала) и нажмите «Сохранить».